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         在生物體內各種翻譯后修飾過程不是孤立存在的，當某個關鍵蛋白發生修飾后，會影響與其直接相互作用的蛋白或導致通路上下游蛋白發生變化。蛋白互作網絡是用于分析這一復雜生物過程的有效手段。

    分析方法

          修飾組學與蛋白組學鑒定到的蛋白通過與STRING蛋白網絡互作數據庫比對后，提取confidence score > 0.7（high confidence）的蛋白集合互作關系，用Cytoscape軟件對蛋白互作網絡進行可視化。然后使用MCODE插件挖掘網絡中具有高連通性的模塊，進而對模塊中的蛋白進行功能富集分析，標記出每個模塊可能參與的關鍵生物過程。

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