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    蛋白修飾位點motif分析

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    蛋白修飾位點motif分析

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    項目介紹

         大規模的蛋白質組學實驗可以在一次實驗中鑒定出數千種蛋白質翻譯后修飾位點，了解引起這些修飾的潛在生物學過程是蛋白質組學的重要研究方面，例如了解酶對其底物的偏好性可以幫助闡明它們涉及的生物途徑。由于酶對給定底物的部分生化偏好可能是由修飾位點周圍的殘基決定的，因此生物化學家將研究重點放在確定引起特定酶 - 底物相互作用的關鍵相鄰殘基上，這種蛋白或多肽序列形成的特定殘基模式稱為基序（Motif）。

    分析方法

          使用 Motif-x 或 iceLogo 分析方法預測修飾位點的潛在基序（Motif）特征。將鑒定到的修飾位點上下游各 10 個（磷酸化修飾為上下游各 6 個）氨基酸組成的肽段序列作為分析對象，背景為物種中所有潛在發生修飾位點上下游各 10 個（磷酸化修飾為上下游各 6 個）氨基酸組成的肽段序列，從翻譯后修飾位點周圍提取具有統計學意義的生物學基序 。

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    項目案例

    修飾位點 Motif 特征 iceLogo 圖形展示

    修飾位點附近氨基酸出現頻率富集熱圖

    Motif 特征 logo 圖

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