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    蛋白質磷酸化修飾（Phosphorylation）

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    蛋白質磷酸化修飾（Phosphorylation）

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         蛋白質磷酸化修飾（Phosphorylation）是生物體內最重要的共價修飾方式之一，是目前分布最多、也是最廣泛研究的修飾，其發生過程是在激酶（kinase）催化下，將ATP的磷酸根基團轉移到蛋白的氨基酸（Ser、Tyr、Thr）側鏈上。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及腫瘤發生等過程在內的所有生命活動。發生磷酸化修飾的氨基酸上共價連接磷酸基團，其分子質量會增加發生79.97Da。利用質譜可測定分子量是否發生79.97Da的質量偏移，從而檢測磷酸化修飾肽段及位點。 4D-label free磷酸化蛋白質組學是基于timsTOF Pro質譜儀，通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂（ddaPASEF）掃描模式進行差異磷酸化蛋白質組學分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據分子的形狀、截面積屬性，可有效區分修飾同分異構多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

    技術路線

    技術優勢

    1. 4D技術加持，提高定量的準確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

    2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制，靈活方便；

    3. 基于質譜平臺（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

    4. 經驗豐富——超17年蛋白平臺服務經驗，擁有豐富的高水平項目文章；

    5. 數據保證——采用進口金標抗體，數據結果穩定可靠；

    6. 系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析，實現快捷”一站式”服務。

    數據分析

    1、標準數據分析內容

    鑒定分析：鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

    表達差異分析：差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

    多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

    功能分析：亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

    質量控制分析：肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

    2、高級數據分析

    功能分析：GSEA富集分析。

    臨床藥物研究：藥物靶點注釋。

    標志物篩選：集成機器學習。

    與臨床表征的聯合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

    推薦組合產品

    1. 蛋白質組+磷酸化組：全面剖析機體調控網絡。

    2. 磷酸化組+代謝組：打通機體表型-機制研究通路。

    推薦應用領域

    1. 神經及退行性疾病；

    2. 腫瘤發病機制研究；

    3. 藥理藥靶研究。


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    蛋白質磷酸化修飾（Phosphorylation）

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