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    染色質構象捕獲(Hi-C)

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    染色質構象捕獲(Hi-C)

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    項目介紹

    Hi-C技術源于染色體構象捕獲 (Chromosome conformation capture, 3C)技術,以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,通過對染色質內全部DNA相互作用模式進行捕獲,獲得高分辨率的染色質三維結構信息。

    技術特點:

     1. 研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系

     2. 基因組組裝組裝水平提升到染色體水平。

     3. 無需群體,單個個體就能實現染色體定位,周期短,成本低

     4. 相對遺傳圖譜,標記密度更大,序列定位更完整

    實驗流程:

    分析流程:

    標準分析

    (1) 數據過濾及比對

    (2) ChIP分布趨勢分析

    高級分析

    (3) 染色體互作分析

    (4) 與ChIP聯合分析

    (5) 轉錄組聯合分析

    (6) 染色體三維結構模型構建

    樣品要求

    細胞數:≥1ⅹ107     交聯固定后干冰運輸

    項目案例

    染色質構象捕獲(Hi-C)

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